Aider la recherche avec le calcul distribué, Réactions à la news du 17-12-2007

[geeko]

ces projets utilise de l'espace disque,
time machine ne risque-t-il pas de le sauvegarder et donc de faire enfler le dossier backup???

[Black Hole Sun]

ces projets utilise de l'espace disque,
time machine ne risque-t-il pas de le sauvegarder et donc de faire enfler le dossier backup???

Exact
Time Machine va sauvegarder le contenu de Boinc (y compris les unités de travail en cours et celles en attente de traitement).
Selon le projet (car c'est très variable), le dossier sera plus ou moins gros. Les projets de Climatologie sont réputés pour le temps de calcul nécessaire (souvent plus de 1000 heures) et la taille très conséquente des unités. Pour les autres projets, c'est plutôt limité.

Bien évidemment les machines a 2, 4 ou 8 cores impliqueront un dossier plus conséquent. Mais globalement, un dossier Boinc typique utilise environ 100 Mo voire moins

[noop]

les résultats sont versés dans le domaine public et profitent donc à l'humanité entière.

Oui, mais leur utilisation n'est pas a but non lucratif. Il suffit que n'importe quel laboratoire exploite ces résultats, dépose un brevet et hop terminé le coté "j'aide l'humanité avec mon ordinateur".

J'ai essayé plusieurs fois de participer à ce genre de "bénévolat" et en examinant les clauses, très souvent elles ne sont pas blindées ou alors elles sont exploitées par des fondations très très opaques.

Ce message a été modifié par noop - 17 Dec 2007, 12:46.

[adinx]

Merci Black Hole Sun pour ces ajouts d'explications. Je crois que je vais me laisser tenter.

[Black Hole Sun]

les résultats sont versés dans le domaine public et profitent donc à l'humanité entière.

Oui, mais leur utilisation n'est pas a but non lucratif. Il suffit que n'importe quel laboratoire exploite ces résultats, dépose un brevet et hop terminé le coté "j'aide l'humanité avec mon ordinateur".

J'ai essayé plusieurs fois de participer à ce genre de "bénévolat" et en examinant les clauses, très souvent elles ne sont pas blindées ou alors elles sont exploitées par des fondations très très opaques.

Domaine public = gratuitement exploitable.
Ce qui signifie également qu'il n'est pas possible de déposer un brevêt dessus

En clair, un laboratoire pourra exploiter les résultats et en faire un médicament (dans le cas de projets bio-médicaux). En revanche, il ne pourra pas le protéger pour être le seul à le vendre, et ne pourra donc pas le proposer à un prix exhorbitant (car ses concurrents se chargeront rapidement de proposer la même chose moins cher).

En résumé, si un médicament est trouvé par le biais d'un projet de calcul distribué qui verse les résultats dans le domaine public, le médicament devient de fait un "générique" et n'importe quel labo peut le fabriquer (y compris des labos dans les pays pauvres économiquement qui sont bien souvent ravagés par le fléau en question [SIDA, Malaria ....]).
Alors certes, le médicament en question ne sera pas gratuit : il faudra que le labo "facture" ses frais de production et de distribution, et y ajouter sa marge. Mais il ne pourra pas justifier d'un prix élevé comme c'est le cas habituellement pour amortir ses frais de recherche et développement (qui coûtent chers) puisqu'il n'y en aura aucun.

Ce message a été modifié par Black Hole Sun - 17 Dec 2007, 13:00.

[alipse]

les résultats sont versés dans le domaine public et profitent donc à l'humanité entière.

Oui, mais leur utilisation n'est pas a but non lucratif. Il suffit que n'importe quel laboratoire exploite ces résultats, dépose un brevet et hop terminé le coté "j'aide l'humanité avec mon ordinateur".

J'ai essayé plusieurs fois de participer à ce genre de "bénévolat" et en examinant les clauses, très souvent elles ne sont pas blindées ou alors elles sont exploitées par des fondations très très opaques.

Tu as raison, le laboratoire pourra eventuellement utiliser le résultat, mais n'aura pas, l'exclusivité. Après, c'est difficile de tout controler, on peut surveiller que les résultats soient rendus publics, mais leur utilisation nous dépasse.
Ceci dit, les recherches biomédicales, sont faites par des universités, pas par des groupes pharmacologiques.
Comme je le disais juste avant, on ne peut jamais savoir à quels fins seront utilisés, dans le futur, les recherches fondamentales


Ceci dit, il existe des projets non bio médicaux, tels que ceux liés à l'astronomie. Ces recherches sont nécessaires pour faire avancer nos connaissances, mais les résultats ne seront probablement jamais exploités "commercialement".

[Tokugawa]

Autre petite question, histoire de nous rassurer un peu plus.
Dans le Readme.rtf, on peut lire ceci :

Starting with version 5.5.4 of the BOINC Manager for the Macintosh, the BOINC installer creates 2 new "hidden" users boinc_master and boinc_project, and two new "hidden" groups, also named boinc_master and boinc_project (unless they were created by a previous installation of BOINC.)

Même si on nous explique ensuite que c'est pour notre bien... n'y a-t-il pas une autre méthode que de créer deux utilisateurs cachés et deux groupes pour une appli ?
Y a-t-il d'autrs appli qui font la même chose mais en se cachant moins ?
Si chaque appli faisait de même, ç deviendrait vite ingérable


Autre question : puis-je désactiver l'appli (et donc le calcul) quand je le veux ?

[dudumomo]

Bonjour
Je suis également membre de l'AF.
Pour répondre à une de tes questions Tokugawa,
Tu peux arreter quand tu veux BOINC, je ne suis pas utilisateurs de MAC désolé (je suis plus linux...), mais sous windob il suffit de fermer le logiciel pour que le calcul soit sauvegarder puis l'arret des calculs.
Tu peux meme limiter l'utilisation de l'espace disque ou du processeur (70% par exemple,...)

[bzhnono]

Autre petite question, histoire de nous rassurer un peu plus.
Dans le Readme.rtf, on peut lire ceci :

Starting with version 5.5.4 of the BOINC Manager for the Macintosh, the BOINC installer creates 2 new "hidden" users boinc_master and boinc_project, and two new "hidden" groups, also named boinc_master and boinc_project (unless they were created by a previous installation of BOINC.)

Même si on nous explique ensuite que c'est pour notre bien... n'y a-t-il pas une autre méthode que de créer deux utilisateurs cachés et deux groupes pour une appli ?
Y a-t-il d'autrs appli qui font la même chose mais en se cachant moins ?
Si chaque appli faisait de même, ç deviendrait vite ingérable


Autre question : puis-je désactiver l'appli (et donc le calcul) quand je le veux ?

Apache, mysql etc. font souvent la meme chose en s'installant
Le tout c'est que ces users n'est pas possibilité de se connecter à distance à la machine et apres pas de soucis.

Pour ce qui est de la gestion du calcul et de l'appli, le Boinc Manager permet de mettre des préferences (calcul que si inactif, utiliser que XX% du CPU, ne calculer qu'entre XX heure et YY heure etc.) et te permet egalement de suspendre manuellement les calculs.
Pour désactiver completement, il suffit de Pomme-Qer l'appli

[Ogur]

Je confirme, BOINC est configurable à volonté : heures d'activités, fonctionner si le portable tourne sur la batterie ou pas, pourcentages de mémoire/CPU aloués, etc.

[Thrr-Gilag]

Autre petite question, histoire de nous rassurer un peu plus.
Dans le Readme.rtf, on peut lire ceci :

Starting with version 5.5.4 of the BOINC Manager for the Macintosh, the BOINC installer creates 2 new "hidden" users boinc_master and boinc_project, and two new "hidden" groups, also named boinc_master and boinc_project (unless they were created by a previous installation of BOINC.)

Même si on nous explique ensuite que c'est pour notre bien... n'y a-t-il pas une autre méthode que de créer deux utilisateurs cachés et deux groupes pour une appli ?
Y a-t-il d'autrs appli qui font la même chose mais en se cachant moins ?
Si chaque appli faisait de même, ç deviendrait vite ingérable


Autre question : puis-je désactiver l'appli (et donc le calcul) quand je le veux ?

Bonjour,

La création d'utilisateur se fait ici afin d'exécuter boinc avec des droits restreints (meilleure sécurité).

La définition d'utilisateur caché signifie (du moins pour linux, désolé, je ne connais pas les mac) que l'utilisateur créé n'apparait pas dans la liste des utilisateurs du PC (en fait il s'agit d'un compte équivalent à ceux créés par le système comme par exemple www-data pour un serveur apache).

Voila globalement le pourquoi de la création du dit utilisateur caché.

Cordialement, un AFien

[Tokugawa]

Oki, merci pour ces infos.

Bon, ben.. Je vais essayer
Surtout si en plus on peut limiter l'utilisation du proc. 100% tout le temps, ça ne m'emballait pas (cause : ventilo à fond)

[cyrill]

Très intéressant ce projet. Je suis très intéressé par le calcul distribué, au regard des possibilités colossales qui peuvent en résulter.

En revanche, le fait que l'exploitation de la puissance rendue par BOINC (Berkeley Open Infrastructure for Network Computing) soit limité à quelques projets imposés n'est pas forcément équitable. En effet, en tant que particulier contribuant, il serait appréciable de pouvoir également exploiter, selon sa participation, une certaine puissance de calcul en retour.

En fait, l'idéal serait de faire évoluer ce projet en P2P de CPU. Ainsi, on pourrait à la fois fournir du CPU et ensuite, temporairement, en consommer (selon un système de cotas). Tout le monde serait dès lors gagnant.

Dans ce cadre, les principaux projets actuellement proposés pourraient se voir adresser une cotation bien plus généreuse que celle attribuée aux particuliers en général. Ceci créerait une dynamique et tout le monde y trouverait son compte.

Pour l'intéropérabilité et la sécurité, on pourrait aussi prévoir l'exécution d'un tel client P2P de CPU dans un environnement Java cloisonné (selon le principe du bac à sable).

Comme beaucoup, je pense que c'est l'avenir. Ca finira forcément par arriver. Mais le plus tôt sera le mieux.

[fransoi78]

Ceci dit, les recherches biomédicales, sont faites par des universités, pas par des groupes pharmacologiques.
Comme je le disais juste avant, on ne peut jamais savoir à quels fins seront utilisés, dans le futur, les recherches fondamentales

Une grande partie des recherches Biomedicales sont le fait de grand labo de pharma. Si tu ne prends que la fixation proteine/recepteur et synthese proteique, ca va, la plus part du temps, etre utiliser pour remplacer la proteine par autre chose (= un medicament) et comment synthetiser un medicament qui va pouvoir remplacer la proteine.
Les 7 premiers projet de cette page sont tous des recherches qui peuvent ou ont des possibilité d'aboutir sur des medicaments.

Ce message a été modifié par fransoi78 - 17 Dec 2007, 13:46.

[Palito]

Salut,

Je suis utilisateur professionnel (je bosse sur mac) et je participe a boinc dans l'equipe AF deja évoquée.

Je vais répondre rapidement aux questions que j'ai vu.

- Ne pas faire tourner Boinc a 100% sur les macbook, le systeme de refroidissement est tellement pas adapté que ca fait un bruit de fout et ca crache du (tres) chaud j'ai pas testé les macbook pro, mais les imacs c'est silencieux (enfin pas de différence par rapport a d'habitue).

- Je ne sais pas si faire tourner un pc a 100% reduit sa durée de vite mais normalement a sa sortie chaque composant (proc/cm/ram) est cencé pouvoir au tourner au minimum 24h 7j pendant 5ans ... je crois alors bon

- La consomation / Chaleur bruit ca augmente dans tout les cas, cependant pour les imac intel qui ont du matos de portable, ca reste modéré, pour les mac pro (surtout en G5) c'est plus important.

- Tous les projets ne marche pas sur Mac, de plus en plus grace au macintel.

- Projet : ceci dit, chacun est maitre de son hardware, et fait le projet qu'il veux, perso j'ai commencé contre le sida, et j'ai migrer vers de la bio pur et la cosmologie. Actuellement je participe au raid sur un projet mahématique, mais j'y etais pas obligé c'etait pour battre seti germany, apres je vais revenir sur des projet qui me tiennent plus a coeur.

-Pour le coup des user, j'avais cela (par hasard) mais je ne vois pas en quoi ca peux gener, il ne sont pas visible (en tout cas chez mois) dans les utilisateurs finaux.

-Time machine, je ne sais pas mais y'a surement moyen d'exclure des dossiers.

Bon je vous laisse, je retourne bosser ... sur mon mac


@+

Ce message a été modifié par Palito - 17 Dec 2007, 13:54.

[alipse]

Ceci dit, les recherches biomédicales, sont faites par des universités, pas par des groupes pharmacologiques.
Comme je le disais juste avant, on ne peut jamais savoir à quels fins seront utilisés, dans le futur, les recherches fondamentales

Une grande partie des recherches Biomedicales sont le fait de grand labo de pharma. Si tu ne prends que la fixation proteine/recepteur et synthese proteique, ca va, la plus part du temps, etre utiliser pour remplacer la proteine par autre chose (= un medicament) et comment synthetiser un medicament qui va pouvoir remplacer la proteine.
Les 7 premiers projet de cette page sont tous des recherches qui peuvent ou ont des possibilité d'aboutir sur des medicaments.

En fait 6/7 sont des projets faisant parti du WCG (World Community Grid) cela étant, d'autres universités proposent avec leur méthode, de modéliser le comportement des protéines, et d'un ligand.


Ce qu'il faut c'est veiller à ce que les résultats tombent dans le domaine public.

[popey]

Un autre projet de calcul partagé sur lequel je suis tombé récemment :
http://www.macresearch.org/openmacgrid

En gros, il s'agit de construire une grille de calcule basée sur le xgrid d'apple, mis à disposition de tous : un simple formulaire sur le site permet de soumettre un projet.

Je trouve l'idée sympa, car très facilement accessible à n'importe quelle personne qui à un projet serieux gourmand en cpu.
Ca aurait été vachement bien pour un amis, qui aurait pu réaliser des simulations pour sa thèse en quelques minutes au lieu de plusieurs heures. A l'époque, on avait fait une grille de 6 proc avec des machines perso empruntées à droite à gauche.

[Tokugawa]

Ah... Apparement, on ne peut pas choisir le disque dur pour les fichiers temporaires

[fransoi78]

En fait 6/7 sont des projets faisant parti du WCG (World Community Grid) cela étant, d'autres universités proposent avec leur méthode, de modéliser le comportement des protéines, et d'un ligand.

Mes profs de Licence nous avaient bassiné avec l'importance de la modélisation par ordinateurs pour leurs recherches, dommage qu'il n'y ai aucun projet en cours qui soit à l'initiative d'une université française. Je pense que je vais retourner les voir pour leur souffler l'idée.

Ce qu'il faut c'est veiller à ce que les résultats tombent dans le domaine public.

C'est ce qui me parait important : L'humanité bosse sur ce projet, le projet lui appartient donc...

-Time machine, je ne sais pas mais y'a surement moyen d'exclure des dossiers.

Très facile ! C'est dans les préférences on exclu ce que l'on ne veut pas sauver.

Ce message a été modifié par fransoi78 - 17 Dec 2007, 14:07.

[GeJe]

Je confirme, BOINC est configurable à volonté : heures d'activités, fonctionner si le portable tourne sur la batterie ou pas, pourcentages de mémoire/CPU aloués, etc.

Deux remarques si quelqu'un qui écrit le BOINC Manager nous lit :

• il faudrait gérer deux périodes horaires pour s'adapter aux plages à coût réduit d'électricité EDF : 14h-17h et 02h-05h. Il n'y en a qu'une actuellement. Et pousser le vice à faire s'allumer et s'éteindre la machine à ces plages horaires (déjà réalisable par les préférences système).

• Pourrait-on (peut-on ?) retirer l'icône de la barre de menu, elle jure terriblement avec les autres lorsque l'on garde des icônes noir et blanc seulement ! (je chipote, mais bon…)

[Black Hole Sun]

Ah... Apparement, on ne peut pas choisir le disque dur pour les fichiers temporaires

C'est exact

En revanche, tu peux décider où tu veux installer Boinc (sur PC en tout cas, sur Mac, je ne sais pas )

Ici, j'ai Boinc qui tourne sur une clé usb pour le portable

[fransoi78]

Deux remarques si quelqu'un qui écrit le BOINC Manager nous lit :

Oui il y en a. (mais pas moi)

Ce message a été modifié par fransoi78 - 17 Dec 2007, 14:14.

[Palito]

En revanche, tu peux décider où tu veux installer Boinc (sur PC en tout cas, sur Mac, je ne sais pas )

Non

[fransoi78]

En revanche, tu peux décider où tu veux installer Boinc (sur PC en tout cas, sur Mac, je ne sais pas )

Non

Apres l'installation sur un MacBook (Léopard) j'ai deplacé des application vers un autre dossier Boinc.

[Edit] J'oubliais : ceux qui ont des MacBook vous pouvez utiliser la "simple view" (dans preferences) pour mettre l'utilisation du processeur à 60% max pour éviter le déclenchement des ventilateurs.

Ce message a été modifié par fransoi78 - 17 Dec 2007, 14:22.

[BombX]

Deux remarques si quelqu'un qui écrit le BOINC Manager nous lit :


• il faudrait gérer deux périodes horaires pour s'adapter aux plages à coût réduit d'électricité EDF : 14h-17h et 02h-05h. Il n'y en a qu'une actuellement. Et pousser le vice à faire s'allumer et s'éteindre la machine à ces plages horaires (déjà réalisable par les préférences système).

• Pourrait-on (peut-on ?) retirer l'icône de la barre de menu, elle jure terriblement avec les autres lorsque l'on garde des icônes noir et blanc seulement ! (je chipote, mais bon…)

Le plus simple (comme pour beaucoup d'applications) est de contacter l'équipe de développeurs. Dans le cas de boinc il y a un message board :

http://boinc.berkeley.edu/dev/

Vous pourrez ainsi faire entendre la voix des macusers...

[Ogur]

Question au niveau de la consommation : Les portables sont branchés sur un transformateur, le fait de mouliner à fond va t-il faire augmenter la consommation de celui-ci sur le réseau? Logiquement je me dis que non, mais je n'en suis absolument pas certain...

[popey]

Ogur : je ne comprend pas trop la question : la machine, en moulinant à fond, vas bien sûr consommer plus de courant, mais je ne suis pas sûr que ça réponde à la question.

[Palito]

Moi non plus je crois que je ne comprends pas la question.

Tu te demande si ton pc (heu mac) consome plus si ca se verra ?
Ca depend ou tu es branche (prise spéciale )

[Yves-P]

Question au niveau de la consommation : Les portables sont branchés sur un transformateur, le fait de mouliner à fond va t-il faire augmenter la consommation de celui-ci sur le réseau?

Oui.

[cyrille32]

Les processeurs modernes ont au moins deux états différents en fonction de la charge. Même un Mac Pro octo 3 GHz repasse à 1 GHz sur ses coeurs s'ils sont peu sollicités.
{...}
Ensuite, pensez à la mettre en veille si vous ne l'utilisez pas.

quand j'ai eu mon 1er mac en 1998 (un 8600) le vendeur m'a dit:
"mets le en veille le soir, c'est l'allumer qui l'abime car c'est un gros flux electrique qui arrive d'un coup !"

j'ai réfléchit à la chose un ceratin temps et l'ai prise pour une imbécilité en me basant sur les faits suivants :
- comment abimer un appareil éléctrique avec de l'électricité (?)
- et qu'éteindre un moteur de voiture puis redémarrer devient intéressant en terme de consommation au bout de qq minutes

de meme pour un ordinateur il est plus judicieux de l'éteidre si l'on ne va pas s'en servir pendant une heure,
(le redémarrage ne prenant plus qu'une poignée de secondes...)

non ?