Microsoft veut stocker des données sur de l'ADN, Réactions à la publication du 29/04/2016

[Lionel]

Le premier avril 2008 nous vous avions proposé une brève "poisson" dans laquelle nous vous annoncions que le CNRS avait mis au point un système de stockage de données dans l'ADN de moisissures.
La réalité (sans grande surprise) rejoint maintenant la fiction.
Microsoft a passé un contrat avec la startup Twist Bioscience spécialisée dans le stockage des données sur ADN. Le but est d'explorer cette voie prometteuse pour l'avenir et ainsi de trouver un moyen d'avoir un système de stockage qui aurait non seulement une densité colossale mais serait aussi capable d'être dupliqué, démultiplié facilement pour en assurer la redondance.

L'avenir nous dira si l'on s'oriente à terme vers une vraie branche de l'électronique basée sur des biotechnologies.

Lien vers le billet original

[lechneric]

Restera plus qu'à brancher une souris sur le port USB, par contre il faudra bien la nourrir car si elle claque aucune chance de récupération .... quoique le système du congel pourrait effectivement être efficace

[hellomorld]

Bientôt il faudra nourrir les disques durs

[sebi99]

plutot que d'echanger une clef usb, il suffira de rouler une pelle a une collegue, ca va poser des problèmes .....

[amike2]

S'inspirer de la nature pour copier la capacité de l'ADN à s'auto-réparer, et rester identique des siècles, OK.
Utiliser de l'ADN, j'en doute ou alors il s'agit de l'habituelle course aux brevets...

Ce message a été modifié par amike2 - 29 Apr 2016, 10:42.

[raoulito]

l'adn n'est vraiment pas ce que l'on appelle un support fiable dans la durée. Il se dégrade très vite. Et je doute également de la lecture à la vitesse d'un SSD.
En fait c'est possiblement pour un stockage futur à froid.. (là ou justement, pour le coup, le vrai froid)

[Lionel]

l'adn n'est vraiment pas ce que l'on appelle un support fiable dans la durée. Il se dégrade très vite. Et je doute également de la lecture à la vitesse d'un SSD.
En fait c'est possiblement pour un stockage futur à froid.. (là ou justement, pour le coup, le vrai froid)

Pas forcément:
- Les spores prises en exemple dans mon poisson peuvent survivre des années sans altérations de leur ADN
- Au niveau cellulaire, il y a des systèmes de réparation, certains ultra performants chez des bactéries, qui régénèrent l'ADN.

[X_Gebo]

- Au niveau cellulaire, il y a des systèmes de réparation, certains ultra performants chez des bactéries, qui régénèrent l'ADN.

… et d'autres qui altèrent la duplication de l'ADN, c'est le cas, par exemple, du cancer.

[sgmsg]

Je vois mal comment lire et écire rapidement sur l'ADN...

[lopiko]

Le premier avril 2008 nous vous avions proposé une brève "poisson" dans laquelle nous vous annoncions que le CNRS avait mis au point un système de stockage de données dans l'ADN de moisissures.

Et tu voudrais qu'on te crois maintenant ?

[Lionel]

- Au niveau cellulaire, il y a des systèmes de réparation, certains ultra performants chez des bactéries, qui régénèrent l'ADN.

… et d'autres qui altèrent la duplication de l'ADN, c'est le cas, par exemple, du cancer.

Oui, mais l'histoire prouve qu'il y a plus de cellules saines que des cancéreuses

[ide508]

l'adn n'est vraiment pas ce que l'on appelle un support fiable dans la durée. Il se dégrade très vite. Et je doute également de la lecture à la vitesse d'un SSD.
En fait c'est possiblement pour un stockage futur à froid.. (là ou justement, pour le coup, le vrai froid)

http://www.tdg.ch/monde/identifiee-46-ans-.../story/17995123

[FolasEnShort]

l'adn n'est vraiment pas ce que l'on appelle un support fiable dans la durée. Il se dégrade très vite. Et je doute également de la lecture à la vitesse d'un SSD.
En fait c'est possiblement pour un stockage futur à froid.. (là ou justement, pour le coup, le vrai froid)

http://www.tdg.ch/monde/identifiee-46-ans-.../story/17995123

http://www.maxisciences.com/dinosaure/des-...s_art27240.html

[__otto__]

l'adn n'est vraiment pas ce que l'on appelle un support fiable dans la durée. Il se dégrade très vite. Et je doute également de la lecture à la vitesse d'un SSD.
En fait c'est possiblement pour un stockage futur à froid.. (là ou justement, pour le coup, le vrai froid)

Des bactéries qui dorment des centaines d'années avant de se réveiller... c'est pas si mal...

[Xdave]

plutot que d'echanger une clef usb, il suffira de rouler une pelle a une collegue, ca va poser des problèmes .....

Je préfère le plug 'n play.

[FolasEnShort]

Sauf que pour la prise jack, y'a de fortes chances que tu repasses, Apple supprimant de plus en plus.

[raoulito]

- Au niveau cellulaire, il y a des systèmes de réparation, certains ultra performants chez des bactéries, qui régénèrent l'ADN.

… et d'autres qui altèrent la duplication de l'ADN, c'est le cas, par exemple, du cancer.

Oui, mais l'histoire prouve qu'il y a plus de cellules saines que des cancéreuses

on imagine quand même un cancer du support de stockage

l'adn n'est vraiment pas ce que l'on appelle un support fiable dans la durée. Il se dégrade très vite. Et je doute également de la lecture à la vitesse d'un SSD.
En fait c'est possiblement pour un stockage futur à froid.. (là ou justement, pour le coup, le vrai froid)

http://www.tdg.ch/monde/identifiee-46-ans-.../story/17995123

http://www.maxisciences.com/dinosaure/des-...s_art27240.html

du calme les gars. vous voulez comparer le travail pour récupérer de l'adn et le comparer à celui d'un accès à des données type disque dur ?

[FolasEnShort]

du calme les gars. vous voulez comparer le travail pour récupérer de l'adn et le comparer à celui d'un accès à des données type disque dur ?

J'aimerais comprendre cette phrase.

[Starfleet Comman...]

l'adn n'est vraiment pas ce que l'on appelle un support fiable dans la durée. Il se dégrade très vite.

Au contraire, 3 ou 4 milliard d'année d'évolution ont justement sélectionné l'ADN comme le support le plus fiable possible dans la durée (c'est le rôle principale de l'ADN).

Il ne faut pas confondre les propriété intrinsèque de l'ADN isolé et ceux de L'ADN associé à toute la machinerie enzymatique cellulaire, qui est la source entre autres des mutations (voulus ou non selon le contexte) et qui contient entre autres des DNAse capable de dégrader l'ADN pour faire le ménage.

En laboratoire, L'ADN dans un tube (dans de l"eau ou un tampon spécifique) peut être sans problème conservé à température ambiante des mois, voir des années, bien que pour être prudent l'on le stock à des température entre -20 °C et 4°C, voir à -80 °C ou -180°C (mais généralement, ça ne sert pas à grand chose pour l'ADN).

L'ADN sous forme déshydrater est encore plus pérenne, et il n'est pas rare que les biologiste moléculaires du monde entier s’envoient par simple lettre postale un construction d'ADN grâce à une goute placé sur un simple papier buvard puis séché (faut pas oublier d'entourer au stylo l'endroit ou on a mis la goutte sinon c'est galère à récupérer).

L'ADN est aussi résistant à la chaleur (dans la limite du raisonnable), c'est grâce à cela que l'on peut faire des amplification d'ADN en laboratoire (PCR) avec des températures qui montre à 97 °C.

Par contre l'ADN n'aime pas trop les UV.


Concernant la vitesse de lecture, si on fait l’analogie avec nos support électronique, il faut considére le débit et le temps d'accés.

Les débit des séquenceur d'ADN sont en croissance exponentiel depuis 10 ans (c'est peu de le dire), aujourd'hui on atteint en gros 1500 Gbase d'ADN/run comme il y a 4 bases possible (si on reste sur les bases naturel), cela fait donc deux bit par base.

Par contre un run dure entre 1 et 3 jours (sans compter l'analyse derrière) du coup cela fait un débit de 1à 3 Tbit/jours, et un temps d’accès pas trop compatible avec l'utilisation en mémoire cache...

Mais bon pour stocker sur des centaines d'années des informations très importantes, quelques jours de lectures ne sont pas trés grave, surtout que d'ici là le débit serait surement améliore par plusieurs ordres de grandeurs (voir une dizaine d'ordre de grandeur au rythme actuelle).

- Au niveau cellulaire, il y a des systèmes de réparation, certains ultra performants chez des bactéries, qui régénèrent l'ADN.

… et d'autres qui altèrent la duplication de l'ADN, c'est le cas, par exemple, du cancer.

Encore une fois il ne faut pas confondre ADN tranquille dans ce tube et ADN dans un contexte cellulaire, qui est dupliqué, manipulé, corrigé, en contact avec normalement de molécules oxydantes et d'enzymes qui l’altère.

Déjà dans ce contexte cellulaire grâce à l'astuce du la double hélice qui duplique l'information (ca marche comme un raid de disque dur), le remplacement de l'uridine de l'ARN par la thymidine de l'ADN,plein d'autre astuce et surtout grâce à des mécanisme de détection et correction des erreurs (qui se dit proof reading en anglais, comme le correcteur orthographique de votre logiciel préférés), l'ADN est très stable dans le temps comte tenu du contexte.

Mais l'ADN isolé si on y touche pas (à l'abri des sources d'UV importante) est encore plus stable, n'a pas raison de muté. Il n'est pas éternel, mais peut rester intact très très longtemps.

C'est comme comparé la stabilité des données sur une bande magnétique que vous laisserai à l'abris dans une armoire , avec la stabilité des même données sur un bande magnétique qui serait sans cesse copier, effacer puis recopier, vous comprenez bien que l'usure et l'accumulation d'erreur lors de la copie des données, ne permet pas de comparer la stabilité des données des deux scénarios.

Ce message a été modifié par Starfleet Command - 29 Apr 2016, 20:01.

[raoulito]

@Starfleet Command bon ben là je vous crois et je me range à l'avis général donc.. (notez comme ceci est rare dans ce forum)
reste à voir les capacités en pratique (si on doit toujours alimenter des systèmes réfrigérants ou autres c'est pas top..)

[Oncle Sophocle]

du calme les gars. vous voulez comparer le travail pour récupérer de l'adn et le comparer à celui d'un accès à des données type disque dur ?

J'aimerais comprendre cette phrase.

Je pense que la phrase de raoulito est un condensé, "récupérer de l'ADN" devrait être écrit : "récupérer l'information contenue dans de l'ADN" ; le commentaire de sgmsg :

Je vois mal comment lire et écire rapidement sur l'ADN...

décrit mieux et en plus court le problème.

Pour moi, cela signifie que la technologie qui amènera au stade industriel le stockage et la récupération d'informations sur de l'ADN reste encore à inventer. Les technologies actuelles de stockage et récupération d'informations (disques durs, modules de stockage statiques = SSD) atteindront un jour leurs limites en capacité, durée, fiabilité et efficacité énergétique. La préparation du futur sera un énorme avantage compétitif pour les entreprises qui peuvent y investir.

Ce message a été modifié par Oncle Sophocle - 29 Apr 2016, 15:57.

[jle67]

l'adn n'est vraiment pas ce que l'on appelle un support fiable dans la durée. Il se dégrade très vite. Et je doute également de la lecture à la vitesse d'un SSD.

Non, l'ADN est intrinsèquement plutôt très résistant… La vitesse de lecture me semble plus un problème… Avec les technologies d'aujourd'hui cela peut faire un excellent support d'archivage.

[X_Gebo]

Au contraire, 3 ou 4 milliard d'année d'évolution ont justement sélectionné l'ADN comme le support le plus fiable possible dans la durée (c'est le rôle principale de l'ADN).
[…]

Merci pour ces explications savantes et détaillées !

[boussiko]

Lionel était visionnaire.

[Starfleet Comman...]

Après tout un autre domaine d'activité et d'utiliser les enzymes ou etre vivant entier pour faire des manipulations voir calculs sur ces données stockées sous forme d'ADN ... On n'en est pas encore là

@Starfleet Command bon ben là je vous crois et je me range à l'avis général donc.. (notez comme ceci est rare dans ce forum)
reste à voir les capacités en pratique (si on doit toujours alimenter des systèmes réfrigérants ou autres c'est pas top..)

Après dans le contexte du vivant ce que vous dites n'est pas totalement faux,, l'ADN subit de très nombreux stress (oxydant, UV, polluant chimique dont cigarette). et la machinerie de réplication et de correction ne peut tolérer qu'un certain nombre d'erreur avant d'être déborder.

Du coup, trop d'UV = trop d'erreur à réparer, donc pas tous réparées, et si au mauvaise endroit sur plusieurs gènes stratégiques, au mieux vieillissement accélérer au pire cancer.

Donc on ne stockera pas nos données dans les cellules d'êtres humains...

Ce message a été modifié par Starfleet Command - 29 Apr 2016, 20:06.

[Pixelux]

Je vois mal comment lire et écire rapidement sur l'ADN...

C'est justement ça qui est le problème avec cette technologie.

[fredlermant]

https://youtu.be/Uwl5MBzTCRQ

[iAPX]

Merci @StarFleetCommander pour ces détails!

Je suis toujours étonné par la diversité des personnes qui peuplent les forums ici, qui ont des connaissances très étendus, voir sont des chercheurs dans des domaines particuliers, et ça enrichi incroyablement le débat!

[raoulito]

oui je suis surpris que Sartmatt ne soit pas encore arrivé pour nous donner un cours sur la technologie d'encodage génétique
Dans la série des ingénieurs en tout de ce forum, tu n'es pas mal non plus !!

Bref, on a des spécialistes en pleins de choses et quelques spécialistes en tout (et un autre gros paquet de spécialistes en engueulade systématique quel que soit le sujet mais justement.. c'est un autre sujet )

[FolasEnShort]

Ce qui serait super c'est qu'on serve nous-même de disque dur! Ach, l'humain aucmenté, mon rêfe!