Script de conversion de donnees [TRANSFERE]

[ANTOINEfromUCSD]

Bonjour a toutes et tous,
Je debute dans la programmation tres basique pour mes besoins professionnels (je suis un jeune medecin et post-doc actuellement en Californie) donc merci de votre indulgence et de vos precieux conseils.
Je cherche a automatiser la conversion de mes donnees via un script.
Mes donnees sont des suites aleatoires de lettres (code a 4 caracteres e.g. 'ATGAAACTGGCCCCC(...)' ou bien >20 differents caracteres "WSGRHTBTRHDTH(...) faisant reference a des nucleotides ou des acides amines). Il n'y a pas d'espaces entre eux et souvent ils sont organises dans le format suivant:
">NOMDUPATIENT1
ATGAAACTGGCCCCC(...........)
>NOMDUPATIENT2
TTGACCCTGGCCCCCAATTTTTGCCC(...........)"

Je souhaiterais pouvoir obtenir
#1.un fichier txt compatible csv avec une lettre par cellule sous cette forme:
">NOMDUPATIENT1 A T G A A A...
>>NOMDUPATIENT2 T T G A C C C T G..."

Dans un deuxieme temps en remplacant les lettres par des chiffres avec un code simple (A=1, T=2, C=3, G=4 pour les nucleotides et A=1, B=2, C=3, D=4 (...) pour les acides amines)
PS: les fichiers d'origine contiennent SOIT des nucleotides SOIT des Acides amines

Merci de vos lumieres
Take care

Ce message a été modifié par ANTOINEfromUCSD - 8 Jan 2013, 05:45.